針對來勢洶洶的巴威颱風，臺南市政府市長黃偉哲已於7月7日下午4時10分召開「巴威颱風臺南市政府防颱整備會議」，要求市府團隊、消防局及 37 區公所全面嚴陣以待，並提出以下18項指示事項，全力守護市民安全。
- 請各區公所、環保局及水利局加強易淹水地區排水設施、雨水下水道及側溝清淤作業，確保排水順暢，降低後續降雨造成積淹水風險，尤其是0625豪雨有積淹水區域。
- 請各編組單位提高戒備加強整備，並呼籲市民留意氣象資訊，做好防颱準備，儘量避免前往山區、水岸、沿海，以維護自身安全。
- 今年汛期相較往年雨量甚多，請各編組單位務必嚴陣以待，對於土石流潛勢區域，請相關區公所隨時注意當地土石滑落及崩塌之情形，並應有預防性疏散撤離之準備，並請水利局及區公所加強土石流監控。
- 颱風期間，易造成本市路樹倒塌、傾斜災情，請工務局、水利局、各區公所及其他權管單位應特別加強樹木固定及修剪工作，避免倒伏，以維護市民與交通安全。
- 針對路燈、大型廣告看板、招牌及工地鷹架圍籬等，請工務局務必加強巡檢，並綁牢固定以保障交通順暢與安全。
- 請水利局、工務局、地政局及其他局處加強巡查各項在建工程嚴堵防汛缺口，並確保車行地下道抽水設備與抽水站、移動式抽水機與水閘門等防汛設施正常運作。
- 請環保局督導各區清潔隊，加強側溝清淤及防砂網落葉及落水口之雜物清除。
- 請民政局與各區公所務必保持聯繫，地方如有災情發生應迅速掌握通報，並通知開口契約廠商進行搶險搶修，同時注意勞工作業安全。
- 請各區公所務必備妥防水擋板、砂包等物，並及早提供市民領取地點及使用方式等資訊，讓市民可預先聯繫區公所領取使用。
- 請各編組單位針對會影響民眾的各項訊息要即時發布訊息，特別是積淹水、封橋封路及土石流等相關訊息。
- 請消防局督導所屬外勤大隊及消防分隊加強檢整各項防颱救災器材。
- 請民政局督導各區公所如成立災害應變中心時應同步成立防災協作中心，有效的運用民力。
- 請民政局督導各區公所針對水災或土石流潛勢地區的保全戶，應主動更新名冊，必要時採取預防性撤離。
- 請消防局、警察局、民政局及各區公所務必再次檢查測試各項通訊設備及發電設備是否都可以正常使用。
- 請消防局針對颱風動向適時劃定並公告本市海岸線、河川、排水、漁港泊地、運河等警戒區。
- 丹娜絲颱風受災戶尚有約136戶以帆布遮蓋，請民政局督導各區公所加強關心受災戶。
- 請各區公所加強宣導民眾要提早啟用防水閘門，尤其是大樓。
- 目前本市境內部分水庫滿水位（南化水庫98.1%），請各水庫管理單位應評估是否提前放水，避免於豪雨期間才開始放水，造成河川水位高漲導至內水無法順利排出。
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