一、台鐵：9月21日(星期日)至24時前行車狀況：
(一)西部幹線(基隆到屏東)：各級列車正常行駛。
(二)東部幹線(宜蘭線、北迴線及跨線列車)：
1.臺北開往宜蘭、花蓮：對號列車自438次(臺北站18：20)起停駛。
2.花蓮開往宜蘭、臺北：對號列車自247次(花蓮站20：30)起停駛。
3.跨線列車：284次自田中站經臺北至七堵站止；655次臺東站到七堵站間停駛。
(三)南迴線、臺東線：至24時前各級列車全部停駛。
(四)宜蘭線、北迴線、屏東線(高雄－枋寮間)及各支線：區間車視風雨狀況機動行駛。
(五)阿里山森林鐵路(嘉義～奮起湖)及各支線(祝山、沼平線及神木線)9月21日至22日，各級列車全線停駛。 。
二、高鐵：14時(含)後恢復正常營運。
三、航空：因受鳳凰颱風影響，中華航空9月21日台南-香港航班取消。
四、國道客運:
(一)統聯：(1)台北—台南: 南下: 一小時二班視風雨狀況行駛。北上:12：00後一小時兩班(經南崁、三重、台北)，視風雨狀況行駛。(2)台北—台南(經國道3號): 南下: 全日停駛。北上: 全日停駛。(3)台中—台南: 南下: 一小時一班視風雨狀況行駛。北上: 12：00後班次一小時2班車視風雨狀況行駛。(4)台北—佳里—漚汪: 南下: 全日停駛。北上: 12：00後一小時一班車視風雨狀況行駛，末班車 19:00。(5)台北—學甲—苓仔寮: 南下: 全日停駛。北上: 全日停駛。(6)台北—西港:南下: 全日停駛。北上: 全日停駛。
(二)國光、和欣：各路線班次視風雨狀況行駛。