針對禽流感疫情，台南市長賴清德今（19）日下午召開台南市動物疫災緊急應變小組第三次會議，會中指示各局處務必依照中央高規格防疫標準執行、做好中長期防疫的心理準備，並妥善分配人力、物力防疫。對此這次撲殺禽類的補助，賴市長將於行政院會向中央爭取提高補助金額或全額補助，並爭取復養農民「無息貸款」，幫助農民渡過難關。
賴市長於會議中特別感謝國軍及市府各局處對於這波禽流感的全力投入，他表示，這波禽流感恐怕不會短期間內就結束，後續防疫有待跨局處合作，包括府內、府外單位，應就現有不足之處調整改進。另外，因應這波禽流感，請市府各單位完全按照中央指示標準作業程序嚴格執行，切不可有任何疏漏，包括採高規格的撲殺條件，例如預防性撲殺，至於撲殺之後養殖場的後續作為，也都必須按照標準作業程序，請務必嚴格遵守。
賴市長強調，鹽水白肉雞在驗出H5禽流感類型後，即依照行政院高規格防疫標準，採取預防性撲殺，但最後檢驗結果是H5N2禽流感，屬舊型禽流感，依照過去防疫標準，並未列入撲殺範圍。這次採取預防性撲殺，對農民造成的損失，他將於本週行政院院會中提案，要求農委會全額補助。
賴市長指出，依據動物傳染病防治條例，H5N8、H5N3、變型種H5N2疫情確診後中央僅補助農民3/5，其中由中央與地方各分擔一半，但鑑於本次疫情非常嚴重，他會提報行政院會，建請中央提高補助比例，甚至爭取全額補助。
賴市長表示，台南市防疫的人力、物力目前都算充足。人力部份，動保處、環保局、國軍已經投入；物力部份，衛生局及相關局處，還有區公所的山貓等也都能互相調度，如有不足之處，再請動保處呈報。針對飼主農民的健康，包括生理、心理，賴市長指示請衛生局協助，至於投入的政府人員，包括生理跟心理，也要一併重視，以保持防疫人員的身心健康。
對於本次投入防疫的人員，賴市長承諾會建請行政院會農委會擬定獎懲機制，他表示，防疫視同作戰，事件結束後，該嘉獎要嘉獎、該記功要記功、該懲處要懲處，提醒所有防疫同仁務必同一條心，嚴格執行中央所交付的任務。另外，他也會於行政院會提議，針對想要復養的農民提供「無息貸款」，而非低利貸款，減少未來農民在復養時的困境。
至於經發局市場處，賴市長強調調查的兩個重點，一個是有嚴格取締確保沒有私宰活禽狀況發生，避免疫情擴散。第二，避免物價哄抬，現在已有媒體報導豬價上升，必須特別了解價格是否合理，有無哄抬價格情事，如有不合理現象，即依法辦理。
賴市長指出，這波疫情後續可能還有相當的時間，兩個禮拜是初步估計，若參考日本、韓國情形，時間會更長。依照動保處預估，後續如果還有70個場次，負擔極大，提醒大家需做好中長期抗戰的心理準備。在人力、物力的調配，務必做到周延，讓整個防疫的工作順利無虞，渡過這波疫情。
針對禽流感疫情，台南市政府農業局動物防疫保護處處長李朝全報告指出，統計至今（19）日上午8時止，台南市禽流感通報死亡數為1萬5162隻，送檢38場，30場確診禽流感，8場送檢中。目前疫情集中於鴨及鵝飼養密集區麻豆及下營。台南市疫情通報比例14％（38場/272場）、台南市在全國水禽飼養比例7.3％（272場/3747場）、通報場佔全國比例13.8％（38場/274場）。農曆年前溫差大，本次疫情預估高峰還要持續10至14天，預估可能發生100場。
至於各局處目前作為：環保局已進駐164位清潔人力、配合撲殺，也結合河川巡守及志工加強稽查；衛生局備有N95口罩防疫物資支援準備及防疫人員，啟動飼主心理諮商；民政局指示各區公所配合，並請感染的8區加強疫情防護等。