為持續追蹤掌控禽流感疫情，市府今(2)日召開動物疫災緊急應變小組第五次會議。針對目前已撲殺的80座飼養場來估算，補償所需經費計約1億2千萬，市長賴清德當場指示動物防疫保護處加速評價，讓已進行撲殺的受災養殖戶盡快領到補償金額；他同時盼望市政府相關單位和中央攜手合作，迅速、有效的把防疫工作徹底完成。
賴市長在會中表示，疫情發生到現在，大家都很辛苦，尤其要感謝動保處，還有區公所的協助。賴市長強調，疫情的每一個環節都要釐清，不足的地方要改善，按照進度完成，比什麼都重要。同時，賴市長也希望國軍能夠再加派人力，協助夜間檢疫站事宜。
動保處簡報指出，在下營、麻豆、後壁區公所協助下，已於1月23日、27日辦理3場撲殺補償評價送核復養說明會。目前已試算80場之補償費，所需費用計約1億2千萬。因彰化縣、雲林縣、嘉義縣、臺南市及屏東縣等縣市，補償費用由中央負擔95%，地方負擔5%，其餘發生縣市由中央負擔90%，地方負擔10%，本市預計需負擔約600萬。
動保處建請各區區長再加強協助撲殺及搬運，並協助僱工，以便能在24小時內撲殺清運完成。而墊料及禽糞清除，也請當地區長務必協助僱工，並視情況調派山貓及垃圾車，一次清除後由動保處消毒，避免交叉感染。
此外，動保處已邀嘉義大學獸醫系協助即刻進行採樣，鴨場採檢監測工作也請畜主協助。在補償作業的部分，動保處已成立一組人員，撲殺後記錄各項資料，以及電請畜主補足缺漏資料。
在未來產銷供應及價格預測部分，農業局畜產科表示，近期家禽產地價格趨勢尚無明顯波動，未來供應量應無虞。因禽流感致民眾消費意願下降，部分家禽地產地價稍降，又因1月24日至27日禁宰，市場零售價格有短暫上升趨勢。但因近期禽流感新聞報導減少，產地價格可能回升。雖在此次疫情中，肉鵝撲殺比例最高，但因其屬小眾市場，近期價格亦無明顯波動，在年前供應量尚可，惟年後可能因先前疫情撲殺而供應短缺。
在毛豬價格部分，先前因PED影響，致103年初開始，豬肉價格陸續上漲至每公斤80元，先前台糖提高釋出供應量後，價格雖下降至76元，惟因禽流感替代效應已突破每公斤80元，又因年節為豬肉需求高峰，價格可能繼續攀升。為此農委會提出訂定拍賣豬隻體重上限，超過上限體重豬隻以拍賣底價計算與增加2月份整體總供應頭數兩項措施，以抑制拍賣價格上漲。