有關黃智賢女士於臉書表示賴市長拒絕中央接管防疫，並透過媒體即時報導，經查其內容完全與事實不符，市府說明如下：
一、行政院於昨天傍晚因高雄確診個案已逾1千例，符合成立中央疫情指揮中心之門檻，宣布今天下午召開第一次中央疫情指揮中心會議，毛院長並親臨致詞，強調成立目的是加大力道控制疫情，登革熱防疫需要中央、地方、跨部會、跨領域全面作戰、全力以赴。衞福部林奏延次長、行政院發言人及疾管署郭署長都明確説明並非「接管」，請黃女士明察。
二、有關登革熱的防治本府向來中央疾管署、環保署南部稽查大隊充分合作，各有職司。面對今年嚴峻的疫情，本府自7月17日成立登革熱疫情指揮中心以來，中央疾管署南區管制中心劉主仼及同仁均參與每次會議與討論，從未缺席。9月8日疾管署長郭旭崧更進駐台南，指導及協助防疫工作。衞福部林奏延次長、環保署魏署長、張子敬副署長等均南下召集相關會議或主持活動，中央與地方合作無間，共同努力防治登革熱。對於防治策略上的化學防治係由疾管署進行疫情調查並劃設區塊及防火牆化學防治範圍，由市府進行室內外的噴藥工作，疾管署並於防治後派員掃蚊檢驗成效及協助市府複查。此外國防部自指揮中心成立以來均派員參加，八軍團季連成指揮官也積極協助市府防疫工作，進行房舎營區土地孳清及支援化學兵噴藥等。自始以來臺南市府與中央合作無間，配合共同進行防疫工作從無間斷，何來賴市長拒絕中央防疫之說，黃智賢所言均為子虛烏有，並非事實。
三、登革熱的防疫工作須由下而上密切配合，不僅僅是市府與中央，更是從市民、區里到全體政府都要全面總動員投入，才可克竟全功控制疫情。對於黃智賢女士多次詆毀賴市長及市府防疫人員，公開於個人臉書謾罵，並透過媒體報導，影響防疫人員士氣，令人遺憾，值此防疫如作戰期間，大家都投入防疫工作，期待這樣的謾罵不再發生。