臺南市登革熱流行疫情指揮中心第20次會議今（16）日舉行，市長賴清德除再次感謝中央及軍方全力支持臺南防疫工作，並表示依據中央衛福部疾管署的分析，目前登革熱疫情與日前連日多雨有關，賴市長再次強調，登革熱防治沒有捷徑，唯有務實做好孳清，輔以化學防治，只要大家攜手持續努力不氣餒，一定可以看到成果。
因中央成立疫情指揮中心，今日起疾管署由副署長周志浩代表郭署長出席。賴市長說，這波登革熱疫情控制，需要中央、地方及全體市民一同參與，防治沒有捷徑，唯有務實做好各類孳清，輔以化學防治工作，以目前化學防治成果來看，捕獲病媒蚊的次數逐漸變少，代表噴藥已有一定之成果，但仍應持續努力不鬆懈。
賴市長於會中作出幾點裁示，第一，今天中華職棒聯盟吳志揚會長來訪，表達臺南球場的比賽不會更動。吳志揚會長深知登革熱並不是人傳人，而是靠蚊子傳染之疾病，不必擔心人群聚集，只要做好孳清防蚊就不必擔心。目前臺南市府相關局處和統一獅球團，已落實臺南市立棒球場孳清工作及化學防治，中華職棒聯盟也在球迷進場時，給與防蚊液等防治措施，請球迷朋友無須擔心，踴躍進場看球。
第二，昨日國防部參謀本部副總長執行官蒲澤春上將親至台南市府，表達國軍全力支持臺南市防疫，包括成立小組前進指揮中心，國軍的加入，將更有助臺南市防疫工作的推展。
第三，請中央環保署南區環境督察大隊在專業上協助防治防火牆的建立，另有關中央權管的空地、空屋、或房舍，甚至是辦公的地點，也請環保署協助檢視。
第四，請全民一起配合防疫工作落實孳清，住在鐵路沿線的市民，亦請配合勿往鐵路範圍內扔擲垃圾及易積水之瓶罐，此舉不僅容易造成防疫人員的負擔，也成為孳清死角，周圍住戶反受其害。
第五，請衛生局及環保舉妥善配合八軍團支援台南之化學防治工作，讓國軍能夠發揮最大效率投入防疫。
周副署長強調，中央絕對是全力支持地方防疫。中央指揮中心的成立並不是媒體所稱的接管，而是整合中央、地方、跨部會、跨領域的資源，大家齊心作戰，加大力道控制疫情。
疾管署南區管制中心劉主任碧隆表示，9月14日及15號兩天實地查核防治後的成效，經掃蚊結果並無發現任何斑紋，顯示化學防治已有效果，惟在少數區里複查時，還是會發現少數陽性容器，並於部分建築工地捕獲斑蚊，因此各區應再確實加強孳清。他表示今年六、七、八月降雨日數很多，尤其是8月24日至31日，持續一周的降雨；雨後孳清需再重來，特别是熱點的疫區，需要全體總動員，持續加強巡查及孳清。
指揮中心各組進行報告，疫情及檢驗醫療組報告指出，截至9月15日止，臺南市本土病例數9105例，北區3095例最多，其次中西區1390例，南區1345排名第三高；值得注意的是仁德區躍升98例，需加強孳清。
病媒密度調查組方面，布氏指數3級以上的有東區富強里、龍山里、小東里、莊敬里以及中西區的民主里。截至9月15日止，衛生局依據傳染病防治法已開出775張罰單；環保局則依廢棄物清理法、臺南市空地空屋管理自治條例及環境清潔自治條例開出1090張罰單。
孳生源清除組報告指出，9月14日及15日兩天，271間學校均進行孳生源自主清除，師生動員人數234,404人，統計發現陽性容器13個，另相關場館孳生源稽查，包括學校、幼兒園、空地場館、體育場館及補習班在內，稽查75處，未發現陽性容器。
化學防治組報告指出，9月3日至9月16日止，計執行48場次、動員336人次、戶數14,744、施藥量864.5公升。區塊防治部分，9月17日於中西區民主里、郡西里、元安里；北區振興里；南區國宅里；9月18日於北區大港里；南區文南里及明亮里將進行防治作業。
宣導教育組方面，計有9月15日計有四則重要錯誤輿情即時更正或由相關局處澄清說明。
另有關活動中心、寺廟、空地(空屋)、殯葬設施之登革熱孳生源複查結果，民政局指出，9月14日至9月15日出動79人至東區、南區、北區、中西區、 安平區、安南區、永康區、善化等8區，複查182處，戶內戶外都沒發現陽性容器；為加強本市各宗教團體登革熱防治及各項防疫措施，民政局將於明（17）日下午2時至4時，假安平區公所四樓禮堂辦理宗教團體登革熱防治衛教宣導；屆時將邀請永康區、東區、南區、北區、中西區、安南區、安平區計7區宗教團體參加。