0206美濃地震，台南市受災嚴重，其中最大災情為建築物及相關附屬設施倒塌、損壞，市府工務局地震後旋即於當日9時動員臺南市建築、土木、結構、大地技師公會，參與災害後危險建築物緊急評估作業，並貼上紅、黃單警示，避免餘震對建築物及民眾造成更大傷害。
至於貼上紅、黃單建築物，近來一再被大眾誤認為必須立即拆除，對此，工務局長吳宗榮特別澄清說明表示，依照內政部災害後危險建築物緊急評估辦法規定，建築物經緊急評估結果有危險之虞者，將於建築物主要出入口張貼危險標誌(紅單、黃單)，並限一定期限內辦理修繕、補強或拆除；並非貼單後就一定要拆除，如逾期未改善或改善後仍有危害公共安全者，必要時，可依建築法第81條規定強制拆除。惟民眾倘對於緊急評估結果有異議者，得於接獲評估結果通知日起10日內，向該局申請複評。
根據統計，截至18日上午9點，總計建築物緊急評估共計通報3680件、未完成評估2891件、已完成評估789件，其中紅單85件、黃單65件。為讓民眾確實了解建築物及相關附屬設施倒塌、損壞災情，經技師公會緊急評估後張貼紅單之建築物，市府會公布於市府0206震災專區。
工務局特別針對緊急評估結果再次說明指出，貼黃單係指建築物非主要結構（室內隔間或天花板等）損壞或鄰近建物傾斜達一定程度以上，致生危險者。紅單指建築物主要結構（柱、樑、外牆、樓版、基礎淘空）損壞或建物傾斜達一定程度以上，致生危險者。後續處理方式為張貼紅、黃單後，會另以書面通知限期所有權人、使用人或管委會辦理修繕、補強或拆除，完竣後檢附安全鑑定報告及相關證明文件，報府同意解除列管後，始得使用。有危險之虞不及通知時，得依建築法第82條逕予強制拆除。
工務局進一步表示，至於張貼紅、黃單建築物，若經市府和公會進一步鑑定影響公共危險者，市府會立即發包拆除。