臺南市政府為避免民眾於梅姬颱風期間前往沿海、溪流、山區進行登山、釣魚、戲水、觀浪、溯溪等活動，導致生命造成危害，因此依據災害防救法規定，於105年9月26日15時30分起，劃定本市轄區「海岸線、臨海、溯溪、土石流地區及漁港泊地等危害警戒區域範圍」，執行限制或禁止人民進入，並執行民眾勸離危險區域作業。相關管制作業至中央氣象局公告本市脫離梅姬颱風警戒區域後撤除。惟警戒區域撤除後，仍請民眾慎防豪雨及強陣風，注意自身安全。